Ang kahalagahan ng paggamit ng computer file system ay nakatutulong upang maayos at mabilis na ma-access ang mga files o datos sa isang computer. Sa pamamagitan ng file system,Organisado ang mga files – Maaaring ilagay ang files sa folders o directories ayon sa kategorya o proyekto, kaya madaling hanapin.Mabilis na paghahanap – Kapag maayos ang file system, mas mabilis ma-access ang kailangan na dokumento o larawan.Proteksyon ng datos – Ang ilang file systems ay may paraan upang maprotektahan ang files laban sa aksidente o pagkawala.Mas mahusay na storage management – Nakakatulong ito sa tamang paggamit ng memory at hard drive space, kaya hindi basta-basta nagiging magulo o puno ang storage.Sa madaling salita, ang file system ay nagbibigay kaayusan, proteksyon, at efficiency sa paggamit ng computer at datos.