Ang pangunahing suliranin o tema sa Takipsilim sa Jakarta ay ang katiwalian sa pamahalaan at kahirapan ng mga tao. Ipinapakita sa kwento kung paano ginagamit ng mga nasa kapangyarihan ang kanilang posisyon para sa pansariling interes, habang maraming mamamayan ang naghihirap at walang boses sa lipunan. Ipinapakita rin dito ang kawalan ng katarungan at ang pag-abuso sa kapangyarihan, na nagiging dahilan ng kawalang-pag-asa ng karaniwang tao. Sa kabuuan, ang akda ay nagpapakita ng madilim na katotohanan sa lipunan na dapat pag-isipan at baguhin.