Ang mga Austronesian ay nagmula sa Taiwan, ngunit ang orihinal nilang pinagmulan ay Timog Tsina. Ayon sa mga pag-aaral at teoryang Austronesian Migration, ang mga Austronesian ay nagmula sa mga sinaunang Neolithic na populasyon sa baybayin ng Timog Tsina bago sila lumipat papuntang Taiwan at saka kumalat sa iba pang bahagi ng Timog-Silangang Asya at Pasipiko.