Ayon kay Henry Otley Beyer, may tatlong pangunahing pangkat ng tao na unang nandayuhan sa Pilipinas batay sa teorya ng Wave Migration. Sila ay:Negritos – mga unang nanirahan na may katangiang maiitim ang balat, pango ang ilong, at kulot ang buhok. Kilala rin sila bilang mga Aeta.Indones – mga grupong dumating mula sa Timog-Silangang Asya, mas maunlad ang pamumuhay kaysa sa Negritos, may permanenteng tirahan, at nagsasagawa ng pangingisda, pangangaso, at pagsasaka.Malay – grupong dumating noong huli sa wave migration, na may impluwensya sa kultura at wika sa Pilipinas at itinuturing ang pinagmulan ng maraming kasalukuyang Pilipino.Ang teoryang ito ay nagpapakita ng sunod-sunod na pagdating ng mga tao sa Pilipinas na parang mga alon ng dagat, kaya tinawag itong Wave Migration Theory.