Narito ang ilang mga pamamaraan na ginamit ng mga Kanluranin, partikular ang mga Espanyol, upang gawing bahagi ng kolonya ang Pilipinas:1. Pagsakop at Militar na Lakad Ginamit ng mga Espanyol ang lakas ng militar upang sakupin ang iba't ibang mga pulo at tribo sa Pilipinas. Ang mga unang misyon ng mga conquistador, gaya ni Miguel López de Legazpi, ay nagdulot ng pagsakop sa mga pangunahing bayan at lungsod. Nag-deploy ang mga Espanyol ng mga sundalo upang pigilan ang mga pag-aalsa at labanan ang mga lokal na lider na lumalaban sa kanilang kapangyarihan.2. Pagtatatag ng mga Misyon at Relihiyosong Institusyon Ang mga misyonaryo, lalo na ang mga prayle, ay nagdala ng Kristiyanismo sa bansa. Itinatag nila ang mga simbahan at paaralan, na nagbigay-diin sa relihiyon bilang bahagi ng buhay ng mga Pilipino. Sa pamamagitan ng mga misyon, natutunan ng mga tao ang mga katuruan ng Kristiyanismo, na naging paraan upang isama ang mga lokal na tao sa kulturang Espanyol.3. Pagsasaayos ng Lipunan at Pamahalaan Ang mga Espanyol ay nagtatag ng mga lokal na pamahalaan at sistema ng pamamahala, tulad ng encomienda system, kung saan ang mga Espanyol ay binigyan ng karapatan na mangolekta ng buwis mula sa mga lokal na tao kapalit ng proteksyon at pag-aalaga. Nagdala ang mga Espanyol ng mga batas na nakabatay sa kanilang sistemang legal, na nagbigay-diin sa kanilang kapangyarihan at kontrol sa mga Pilipino.4. Paggamit ng Ekonomiya Inutos ng mga Espanyol ang pagsasaka at pagmimina sa mga likas na yaman ng Pilipinas, na naging dahilan ng pagsasamantala sa mga lokal na manggagawa. Pinalakas ng mga Espanyol ang kalakalan sa pagitan ng Pilipinas at iba pang mga kolonya, na nagbigay sa kanila ng kita at nagpatibay sa kanilang kapangyarihan.5. Paggamit ng Edukasyon Itinatag ang mga paaralan na pinamamahalaan ng mga prayle, na nagbigay ng edukasyon sa mga kabataang Pilipino sa ilalim ng sistemang Espanyol. Sa pamamagitan ng edukasyon, naipakilala ang mga aspeto ng kulturang Espanyol, tulad ng wika at mga tradisyon, na nagbigay-diin sa kanilang impluwensya.6. Pagpapalawak ng Teritoryo Isinama ng mga Espanyol ang iba't ibang pulo ng bansa sa kanilang teritoryo, na nagresulta sa pagbuo ng isang kolonya mula sa mga magkakaibang kultura at etnisidad. Nagtayo sila ng mga kuta at fortification sa mga lugar na may mahalagang estratehiya sa kalakalan at depensa.Sa kabuuan, ang mga pamamaraang ito ay nagpatibay sa kolonyal na kontrol ng Espanya sa Pilipinas at nagbukas ng daan para sa pag-unlad ng isang bagong lipunan na nahubog ng kanilang mga ideya, kultura, at sistemang pamamahala.