Ang Teoryang Island Origin Hypothesis ay nagsasabing ang mga ninuno ng mga Pilipino ay nagmula sa mga isla ng Southeast Asia, at hindi sa mainland Asia. Ito ay isinusulong ni Felipe Landa Jocano, isang kilalang Filipino anthropologist.Mga pangunahing punto ng teorya:Ang mga unang tao ng Southeast Asia ay produkto ng mahabang proseso ng evolution at paglipat-lipat ng mga tao, at hindi nagmula sa mga nakaraang etnikong pangkat tulad ng Malay, Indonesian, at Filipino.Ang mga fosil na nakita sa iba't ibang bahagi ng rehiyon ay patunay na ang mga sinaunang tao na ito ay magkakapareho ang kultura, paniniwala, gawi, at pati na rin ang mga kagamitan.Ang mga taong ito ay naghiwalay-hiwalay sa paglipat, ang iba ay pumunta sa Pilipinas, ang iba naman sa New Guinea, Java at Borneo.Ang mga fosil na nakita sa Pilipinas, tulad ng Tabon Man na may edad na 21,000 hanggang 22,000 taon, ay nagpapakita na ang tao ay dumating nang mas maaga sa Pilipinas kaysa sa Malay Peninsula.Kaya ang mga unang tao ng Pilipinas ay hindi maaaring nagmula sa rehiyon ng Malay Peninsula.